Всего в 2019-2020 учебном году ведомство провело 406 проверок по контролю за организацией питания в образовательных учреждениях региона.  По их итогам должностным лицам трех школ выписали штрафы за неправильное заполнение документов в пищеблоках, нарушение технологии закладки витамина «С»  в готовое третье блюдо при искусственной витаминизации, а также не полные сведения на маркировке продукции.   В столовых забрали 36,6 килограмм некачественных продуктов, которые использовали для приготовления пищи детям. 

В начальных классах охват горячим питание составил 98,7%, в старших – 94,2%. Двухразовое питание получили 36,8%. Также проверка показала, что в 2019-2020 учебном году 96,2% учащихся школ региона обеспечены одноразовым горячим питанием. Двухразовым — 36,8% учащихся области. 

При этом серьезный общественный резонанс вызвала июньская проверка продуктовых  наборов для новосибирских детей. Выяснилось, что в них не докладывали еды. Неожиданные рейды в тринадцать школ и гимназий города и на три предприятия поставщиков (ООО «Комбинат питания «Левобережный», «Лесонал-К» и «Эврика-11») вскрыли нарушения законодательства при формировании школами продуктовых наборов для обеспечения питания детей из многодетных и малоимущих семей, детей-инвалидов, а также детей с ограниченными возможностями здоровья.

А прокуратура Кировского района Новосибирска вместе со специалистами регионального управления Россельхознадзора в марте этого года выявила несоответствующие нормам сметану и сливочное масло в роддоме №6 и Сибирском авиационном кадетском корпусе им. А. Покрышкина. Кадетов кормили фальсификатом.